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Pouvez-vous vraiment tirer un « Jurassic Park » et extraire l'ADN d'insectes congelés dans l'ambre ?

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Il se peut donc que nous n'extrayions jamais le sang d'un moustique qui a mordu un dinosaure il y a 100 millions d'années et que nous l'utilisions pour ressusciter des dinosaures qui envahissent tout un parc à thème, mais nous n'avons même pas été en mesure d'obtenir un profil ADN complet d'un insecte. congelé dans l'ambre . Encore.



Même les insectes qui ont connu ce malheureux destin longtemps après l'extinction des dinosaures sont trompeurs. Ils peuvent donner l'impression de ramper hier, car les tissus peuvent être exceptionnellement préservés par la résine ou la sève des arbres qui finissent par durcir et se fossiliser, mais cela ne signifie pas que tout reste intact. L'ADN se dégrade trop vite . On l'a parfois trouvé dans des choses aussi bizarres qu'un ancien chewing-gum, mais ce chewing-gum était bien moins ancien que les moustiques piégés dans de la résine fossilisée vieille de 125 millions d'années. Ce ne sont toujours rien comparé à la chose qui a créé un monstre - ou de nombreux monstres - dans parc jurassique , mais leur ADN était trop loin pour être étudié. La vie trouve un chemin, mais pas l'ADN après la mort.

Il est douteux que l'ADN reste longtemps préservé à l'intérieur de la résine, le paléontologue David Peris, qui a dirigé une étude récemment publiée dans PLOS UN , dit SYFY WIRE. « La perméabilité de la résine, en particulier dans des conditions hydratées, en fait un environnement non viable pour la préservation des molécules organiques. »







Bien qu'ils ne ramèneront aucun vélociraptor, une équipe de scientifiques repousse maintenant les limites pour savoir combien de temps l'ADN peut durer dans un spécimen comme celui dont John Hammond était si ravi. Il a survécu plus de fossiles de dinosaures et d'animaux congelés dans le pergélisol que de créatures capturées dans la résine des arbres. L'ambre et d'autres résines se sont avérées loin d'être aussi efficaces pour préserver le code génétique d'un coléoptère ou d'un moustique qu'elles le sont pour préserver l'organisme lui-même, et une contamination possible n'aide pas, mais des méthodes et une technologie mises à jour pourraient éventuellement découvrir un ADN date d'expiration qui pourrait aider à percer les mystères de ADN ancien (ADNa) .

L'ADN préhistorique peut donner aux scientifiques un retour dans le temps pour voir comment quelque chose a évolué au niveau moléculaire et comment ses relations avec d'autres formes de vie ont changé au cours des millénaires. Il peut également déterminer les espèces éteintes et existantes auxquelles un organisme éteint pourrait être lié. Pour savoir combien de temps il faut avant que l'information génétique ne commence à se dégrader, Peris et son équipe ont collecté des échantillons de coléoptères qui venaient juste de succomber à la résine d'arbre il y a 3 à 6 ans. Cela peut sembler loin de tout ce qui est préhistorique, mais puisque personne ne peut remonter des millions d'années dans le temps jusqu'au moment où les insectes fossiles ont été capturés pour la première fois dans la vase, c'est l'occasion de retracer les débuts du processus de dégradation de l'ADN dans les spécimens d'ambre.

'L'ADN ancien sera très dégradé et incomplet, et cela dépend de l'état de conservation (l'ADN ancien peut être mieux préservé que certains ADN actuels si les conditions sont favorables ou non)', a déclaré Peris. «C'est pourquoi il est important de démontrer de quoi provient l'ADN identifié. Dans notre cas, nous avons comparé les séquences avec nos spécimens frais afin de démontrer qu'elles provenaient de coléoptères, mais de différents de nos spécimens frais.'

Contrairement à cette énorme aiguille qui a traversé l'ambre et le moustique dans cette scène emblématique de parc jurassique , extraire l'ADN d'insectes fossilisés dans l'ambre implique souvent de tremper l'échantillon dans du chloroforme pour libérer l'encart avant de broyer les échantillons pour les examiner au microscope. Les chercheurs ont découvert que cela ne faisait qu'accélérer le processus de dégradation. L'ADN commence à se désintégrer presque immédiatement après la mort. L'ambre qui a survécu à cent millions d'années en a déjà assez traversé.





De nombreux facteurs peuvent avoir un impact sur l'ADN de l'insecte à l'intérieur, des conditions dans lesquelles il a été préservé à la rapidité avec laquelle le spécimen a été enterré aux phénomènes géologiques qui se sont produits jusqu'à sa découverte. Il existe une rare exception aux insectes dont l'apparence peut tromper les scientifiques en leur faisant croire que leur ADN a résisté aussi longtemps que leur apparition. Parfois, un insecte est momifié assez vite pour geler le processus de dégradation, l'ADN étant absorbé par les minéraux à mesure que ses tissus se dessèchent. Si cette boule d'ambre est enterrée rapidement par la suite, cela peut offrir encore plus de protection. Les anciens Égyptiens savaient évidemment ce qu'ils faisaient en desséchant un corps avec des sels de natron, puis en le recouvrant d'huiles et de résines.

Malheureusement, cette momification accidentelle et immédiate est rare chez les spécimens ambrés.

'Notre expérience démontre la situation contraire', a déclaré Peris. «Nos spécimens n'étaient pas déshydratés après quelques années à l'intérieur de la résine, mais conservaient toujours des tissus internes frais. Cette situation est justement ce qui rend difficile la conservation des molécules organiques, puisque l'hydratation favorise l'oxydation de ces molécules. De plus, l'ambre et la résine se sont avérés très perméables.'

Lorsque les processus géologiques rendent l'ambre plus perméable, tout ce qui se trouve à l'intérieur est soumis à une dégradation plus rapide de l'ADN, sans parler de la contamination par l'ADN d'autres organismes qui pourraient se trouver dans le sol. Cela explique toutes les erreurs en pensant que les gènes extraits d'un ancien moustique dans l'ambre appartiennent tous à ce moustique, alors qu'ils pourraient appartenir à n'importe quoi.

Peris pense que certaines mesures sont nécessaires pour tirer le meilleur parti de l'ADN d'un insecte dans l'ambre. L'échantillon doit être analysé dans un laboratoire d'ADN qui a déjà eu une expérience avec l'ADNa, mais n'a pas étudié d'organismes similaires aux échantillons en question. L'étude d'une espèce qui a souvent été trouvée fossilisée dans l'ambre est également utile. Il devrait y avoir des témoins comme base de comparaison, y compris ceux dont l'ADN ne peut pas être suffisamment amplifié pour l'étude. Il devrait également y avoir une approche spécialisée pour amplifier l'ADN qui correspond uniquement au génome de cet organisme, par opposition à une autre qui correspond à de nombreux génomes différents, et des répétitions de l'expérience ainsi qu'une analyse de séquençage sont nécessaires pour vérifier en arrière.

'Nous avons démontré que l'ADN peut être conservé à l'intérieur de la résine pendant quelques années, au moins, mais nous avons détecté que les conditions ne sont pas favorables pour garantir que la situation reste ainsi pendant longtemps', a-t-il déclaré. « Nous devons maintenant commencer à examiner pourquoi, combien de temps exactement est le délai et si c'est la situation générale ; nous venons de commencer à l'explorer.

Alors que Peris est quelque peu optimiste quant à l'avenir de l'étude de l'ADN extrait de spécimens de résine, Hammond serait déçu. Ses expériences auraient probablement atteint une impasse. S'il ne pouvait même pas extraire la majeure partie de l'ADN d'un moustique qui aurait pu piquer un dinosaure, il n'y a aucune chance que son parc de rêve prenne vie.